R&D-центры снова в моде: как сэкономить на налогах и страховых взносах для обрабатывающих производств и ИТ-компаний

В ноябре 2025 года Президент РФ подписал Федеральный Закон №425-ФЗ об изменениях в системе налогообложения. Документ предусматривает повышение НДС и некоторые другие меры, обуславливающие рост фискальной нагрузки на бизнес. Предприниматели задумались о том, какие льготы в сферах производства и ИТ могут компенсировать убытки от налоговых нововведений. Существенную сумму поможет сэкономить вывод разработки в Сколково в виде отдельного R&D-подразделения.

Почему R&D-центры снова в моде: обзор трендов

R&D — сокращение от Research and Development (исследования и разработки). Так обозначают виды деятельности, связанные с научным поиском, изобретательством и созданием новых технологий.

До 2020 года для оптимизации расходов компании регистрировали свои R&D-центры как отдельные организации. В результате те подходили под критерии льготных режимов налогообложения.

В 2020 году Правительство РФ инициировало крупный пакет налоговых преференций для цифровой индустрии и некоторых других секторов экономики. Были введены льготы по страховым взносам для обрабатывающих производств и ИТ, пониженные ставки налога на прибыль, отменен НДС, приняты некоторые другие меры. Все это помогло отрасли удержаться на плаву в пандемию коронавируса и на фоне санкционного удара со стороны стран Запада, последовавшего в 2022 году. Необходимость в создании отдельных R&D-центров отпала.

С принятием в конце 2025 года Федерального Закона №425-ФЗ началось сворачивание мер поддержки для ИТ-сектора. В целях пополнения бюджета законодатели увеличили ставки страховых взносов и снизили порог для освобождения от НДС на УСН. Выделение R&D-центра в виде отдельного юридического лица снова стало актуальным.

Важно! ФНС не считает создание обособленной организации на основе отдела исследований и разработок дроблением бизнеса с целью уклонения от уплаты налогов. Практика организации нового юридического лица для соблюдения правил инновационного центра «Сколково» считается приемлемой и необходимой. Это легальный способ применения государственных инструментов поддержки приоритетных отраслей экономики, который не сопряжен ни с какими рисками.

R&D-деятельностью занимаются и многие обрабатывающие производства, как крупные, так и из сегмента МСП. Они тоже могут выделить собственные разработки: экономия по уплаченным налогам в этом направлении составит 30-40%. Регистрация отдельных исследовательских центров — отличная возможность дополнить льготы для обрабатывающих производств и ИТ.

Преимущества Сколково для разработок в производственных и ИТ-компаниях

Фонд «Сколково» создавался в целях облегчения налогового бремени для перспективных инновационных стартапов, которые находятся в начале своего пути. В условиях отсутствия финансовых накоплений и устойчивых позиций на рынке освобождение от налогов является серьезным подспорьем.

Новый закон практически не затронул инновационный центр. Привлекательность Сколково для производств и ИТ осталась на прежнем уровне. В 2026 году резидентам предоставляются следующие льготы:

• 0% налог на прибыль;
• освобождение от уплаты НДС;
• 15% ставка по страховым взносам для сумм свыше 1,5 МРОТ;
• 0% земельный и имущественный налог;
• полное возмещение таможенных пошлин и ввозного НДС.

Единственное изменение — запретили совмещать льготы Сколково для разработок с преференциями для компаний с аккредитацией Минцифры. Ранее это позволяло резидентам иннограда снизить выплаты по страховым взносам.

Производственные и ИТ-компании могут интегрировать разработки через инновационные проекты.

Важно! По условиям договора налоговые льготы отменяются после накопления совокупной прибыли в размере 300 млн руб. с момента получения годовой выручки 1 млрд руб. Поэтому целесообразно зарегистрировать R&D-центр в Сколково как отдельную организацию и исключить из ее деятельности непрофильные источники дохода.

Стоит отметить  другие преимущества пребывания в составе участников инновационного центра. Это микрогранты, субсидии и льготные кредиты; доступ к лабораториям и испытательным центрам, экспертное сопровождение; положительный имидж компании и доверие со стороны партнеров.

Налоговые льготы для производства и ИТ-компаний: как сэкономить на основных налогах

Налоговая реформа 2026 г. сохранила привилегии разработчикам до 2030 г.  Компании с аккредитацией Минцифры платят общий налог на прибыль по ставке 5% вместо стандартных 25%. Льготный тариф установлен на период до 2030 года (ст. 1.15 НК РФ). Уплата налога в региональный бюджет не производится. Условие для получения льготы — не менее 70% дохода организации поступает от продажи или обслуживания ПО/электроники.

Налоговые льготы для производства и ИТ можно дополнить следующими способами оптимизации:

1. Применение амортизационной премии. Дает возможность разово учесть 10-30% стоимости основных средств в расходах и тем самым уменьшить налог к уплате в текущем периоде.
2. Резервирование денег на НИОКР. Резерв формируется за счет заблаговременного начисления средств, что тоже подлежит учету в качестве расходов.
3. Применение инвестиционных вычетов. В некоторых случаях снизить налоговую базу можно путем возвращения определенной доли взносов частным инвесторам, в частности, с помощью «Сколково».

Для компаний на УСН в некоторых регионах действуют пониженные ставки налоговых сборов. Например, в Московской области —1% при УСН «Доходы» и 5% при «Доходы минус расходы».

Резиденты «Сколково» работают без НДС, а аккредитованные Минцифры компании также получают освобождение от уплаты НДС при продаже программных продуктов, если те включены в реестр отечественного ПО. Не стоит путать эту льготу с нулевой ставкой налога: при освобождении нет права на вычет НДС.

Льготы по страховым взносам

На страховые взносы приходится немалая доля расходов предприятия. Особенно это касается крупных компаний с многочисленным штатом. Превращение части предприятия в отдельный центр исследования и разработки позволяет снизить выплаты по страховым взносам за каждого сотрудника, работающего по трудовому договору. Например, R&D-центр становится резидентом Фонда «Сколково», тариф по страховым взносам в таком случае составит:

• для сумм в пределах 1,5 федерального МРОТ — 30%;
• для части выплат, превышающих 1,5 МРОТ — 15%.

На сайте Правительства РФ в качестве МРОТ на 2026 год указана сумма 27 093 руб. Таким образом, за работника с годовым доходом в 3 млн руб. компания из Сколково заплатит страховые взносы в размере менее 600 000 руб. 

Если же, например, новый хозяйственный субъект может получить ИТ-аккредитацию от Министерства цифрового развития, связи и массовых коммуникаций (Минцифры). В этом случае для него будет действовать единый пониженный тариф:

• для сумм в пределах единой предельной величины базы (ЕПВБ) — 15%;
• для выплат, превышающих ЕПВБ — 7,6%.

На сайте Правительства РФ ЕПВБ на 2026 год заявлена в размере 2 979 000 руб. Компании, на которые льготы по взносам для обрабатывающих производств и ИТ не распространяются, платят в фонды по ставке 30% в пределах ЕПВБ и 15% за превышение.

Таким образом, за сотрудника с годовым доходом 3 млн руб. обычный предприниматель заплатит менее 900 000 руб., а аккредитованный в Минцифре  — около 450 000 руб.

Примечание. Полезно сравнить льготы по страховым взносам для производства и ИТ. С 2025 года некоторые предприятия обрабатывающей промышленности из реестра МСП платят по тарифу 15% за сумму в 1,5 МРОТ и 7,6% за превышение. Следовательно, за сотрудника с доходом 3 млн руб. в год такая компания уплатит менее 300 000 руб. взносов. Отметим, что для малого и среднего бизнеса из сфер торговли, строительства, добычи полезных ископаемых и некоторых других с 2026 года такие пониженные страховые взносы стали недоступны. 

Экономия на НДС

Резиденты Сколково за собственные разработки НДС не платят, в т.ч. работая на УСН. Льгота действует в течение 10 лет с момента получения статуса резидента Фонда при условии его сохранения.

Освобождение от уплаты НДС не дает право отказываться от оформления счета-фактуры партнерам. В документе ставят отметку «без НДС».

Ежегодно льготу нужно продлевать. Для этого в налоговую подают документы:

• уведомление;
• письменное подтверждение статуса резидента Сколково;
• отчет о финансовых результатах;
• специальный отчет о совокупной прибыли, если ранее годовая выручка составила 1 млрд руб.

Крайний срок информирования — 20-е число месяца, следующего за тем, когда началось использование льготы. То есть по прошествии года с момента ее предоставления резиденту дается 20 дней на продление.

Как реализовать экономию: практические шаги для производственных и ИТ-компаний

Начинать следует с анализа структуры бизнеса. Его цель состоит в определении возможности выделения R&D-подразделения в отдельную организацию. Кроме того, в ходе анализа нередко удается выявить проблемные места и разработать план оптимизации бизнес-процессов. В результате сокращаются затраты на производство.

Далее оформляется резидентство в Сколково:

1. Выбирать подходящий кластер — профильное структурное подразделение в инновационном центре. Описание каждого кластера и направления его деятельности приведено на сайте Фонда «Сколково».
2. Зарегистрироваться на веб-портале инноцентра.
3. Заполнить анкету и подать заявку на предварительную экспертизу. Регистрировать юрлицо для этого не нужно — заявку может подать и физическое лицо.
4. Получить протокол с заключением экспертов. На его подготовку отводится 20 дней.
5. Подать заявку на резидентство в Сколково.
6. Получить статус для вашего R&D-центра.

При желании в процессе регистрации можно выбрать режим очной защиты своего проекта по видеосвязи. Это платная программа, она называется Fast Track. В случае ее применения срок рассмотрения заявки сокращается до 1 дня.

Статуса резидента лишают за непредоставление отчетности в требуемые сроки, невыполнение обязательств, нарушение правил центра Сколково или в случае прекращения деятельности (реорганизации) компании. Также он автоматически прекращается по истечении 10-летнего срока и после превышения лимита на доходы (совокупный доход свыше 300 млн руб. с момента получения годовой выручки 1 млрд руб.).

Если участие в Сколково прервано досрочно за нарушение правил, придется вернуть неуплаченные НДС и другие налоги, но только за тот отчетный период, в котором компанию лишили статуса, а также уплатить пени и штрафы по каждому налогу в соответствующий ему отчетный период. Поэтому рекомендуется относиться к требованиям инноцентра с особым вниманием.

Заключение

Чтобы получить максимальные льготы в производстве и ИТ, целесообразно вывести R&D-подразделение в отдельную компанию и сделать ее резидентом Сколково или аккредитовать в Минцифры. Результатом станут отмена или снижение некоторых налогов, применение выгодных тарифов на страховые взносы, дешевые кредиты и субсидии.

Чтобы грамотно и с максимальной пользой провести выделение R&D-центра, не вызывая подозрений со стороны ФНС, необходимо воспользоваться консультацией специалистов. DV Consulting проанализирует ваш бизнес и разработает пакет рекомендаций. Также мы возьмем на себя получение статуса резидента Фонда «Сколково».   

Свяжитесь с нами, чтобы узнать больше о доступных льготах. Закажите обратный звонок или напишите на электронную почту.