К резидентам Сколково относятся российские компании, занимающиеся разработкой и коммерциализацией инновационных технологий, и получившие статус участника Инновационного центра «Сколково». Этот статус предоставляет им ряд налоговых преференций.
Давайте представим: у вас есть стартап, гениальная идея, но на старте все деньги «съедают» налоги, и вы просто не можете нормально развиваться. Знакомо? Именно для этого и нужен ИЦ «Сколково» с особым налоговым режимом, чтобы компании могли спокойно расти, не беспокоясь о налогах. Это одна из главных мер поддержки для технологического бизнеса. Льготы для участников Сколково действуют все 10 лет, пока фирма является резидентом проекта. Неплохо, правда? А сейчас давайте разберем подробнее, какие существуют налоговые льготы для резидентов Сколково в 2025 году.

Какие налоги платят резиденты Сколково?

Резиденты Сколково не платят НДС. Их освобождают от налогов на прибыль, на имущество. А управляющие компании могут даже не вносить земельный налог. А вот страховые взносы сколковские фирмы платить должны, но для них введены специальные сниженные тарифы на обязательное пенсионное, медицинское, социальное страхование.

Но есть одно важное «но»! Эти преференции перестают работать, если ваш годовой доход превышает 1 миллиард рублей, а прибыль – 300 миллионов. Как только вы пересекаете черту этих лимитов, вы теряете право на налоговые преференции.

Посмотрите, как это выглядит в таблице.

Год	Выручка, млн руб.	Прибыль, млн руб	Право на льготы
2022	800	250	Сохраняется (выручка < 1 млрд, прибыль < 300 млн)
2023	1200	100	Сохраняется (выручка > 1 млрд, но прибыль < 300 млн; включается учёт совокупной прибыли)
2024	950	200	Сохраняется (выручка < 1 млрд, совокупная прибыль за 2023–2024 гг. = 300 млн — ещё в пределах)
2025	1050	150	Утрачивается (совокупная прибыль с момента превышения выручки превысила 300 млн руб.)

Вывод: превышение выручки свыше 1 млрд запускает отслеживание совокупной прибыли. Как только она достигает 300 млн руб., компания теряет право на льготы, даже если в отдельные годы прибыль не превышала лимит.

Льготы Сколково по налогам в 2025 году

Актуальные ставки и сравнения:

1. По страховым взносам применяется пониженная совокупная ставка в размере 14% вместо стандартных 30%. Она распределяется следующим образом: 8% направляется в Пенсионный фонд России (ПФР), 5,1% – в Федеральный фонд обязательного медицинского страхования (ФФОМС), и 0,9% – в Фонд социального страхования (ФСС).
2. Налог на прибыль для резидентов составляет 0% в федеральный бюджет (вместо 20%). На региональном уровне ставка также применяется в размере 0% в течение первых лет участия в проекте, с последующим возможным увеличением до 13,5% при соблюдении определенных условий.
3. Налог на имущество и земельный налог полностью отсутствуют (0%).
4. Льготы по НДС предусматривают освобождение от уплаты налога при реализации прав на программное обеспечение и лицензии.

Льготный налоговый режим для резидентов «Сколково» законодательно продлен до конца 2030 года в соответствии с федеральным законодательством. Однако компания утрачивает право на льготы в случае несоблюдения статусных требований или прекращения соответствия критериям резидента.

Давайте разберемся, как работает система налогообложения Сколково.

Налог на прибыль

Резиденты Сколково налог на прибыль не платят совсем. Чтобы получить эту преференцию, компания должна быть в реестре резидентов, работать на ОСНО (общей системе налогообложения) и сообщить в ФНС о том, что решила использовать эту льготу в течение 50 дней, после занесения в реестр Сколково.

Для продления привилегий нужно ежегодно до 20.01 отправлять в ФНС заявление, выписку из реестра и финансовый отчет. Если превышаете лимиты или заканчивается срок вашего резидентства (10 лет) – бонус снимается.

А если у вашей фирмы был убыток до того, как вы получили льготу по налогу на прибыль, то вы не сможете использовать этот убыток в будущем, чтобы заплатить меньше налогов. То есть, он просто «сгорает».

Каждый год, когда вы пользуетесь льготой, у вас есть выбор: продлить ее или отказаться. Если вы вовремя не отправите в налоговую документы, подтверждающие ваше право на преференцию, или вдруг допустите ошибку в сведениях, вам придется заплатить весь налог, который вы не платили за год. Плюс, налоговики насчитают еще и пени.

Но вы не теряете право на льготу навсегда! Вы сможете снова перестать платить налог, если заново подадите в налоговую все необходимые бумаги.

Как сообщить в налоговую о том, что хотите воспользоваться льготой?

Вот что вам нужно подать:

1. Специальное уведомление о том, что вы используете льготу. В нем есть ячейка «Сообщаю» – там нужно поставить цифру «1».
2. Документы, подтверждающие, что у вас есть статус резидента. Они оформляются по специальным формам, которые выдает УК «Сколково».

Отправить все бумаги нужно не позднее 20-го числа месяца, следующего за тем, с которого вы пользуетесь привилегией.

Вы можете сделать это несколькими способами:

1. Отправить все в файле – через оператора или кабинет налогоплательщика.
2. Переслать почтовой службой заказным письмом. Но тогда помните, что днем отправки считается 6-й рабочий день со дня отправления письма.

Как продлить?

Если вы решили пользоваться преференцией и дальше, вот что нужно сделать. Ежегодно, не позже 20.01, подайте в ФНС:

1. Уведомление о продлении. Это та же форма, что и в первый раз, но в строке «Сообщаю» надо написать «2».
2. Бумаги, которые подтверждают, что вы все еще есть в реестре.
3. Отчет о вашей выручке за год, чтобы доказать, что лимиты не превышались.

Подать все эти документы можно как на бумаге, так и в файлах. Главное – успеть к сроку!

Как отказаться от льготы?

Иногда бывает, что от нулевого налога на прибыль нужно отказаться. Например, если ваша ИТ-компания может получить выгодную ставку в 5% (Письмо Минфина № 03-03-06/1/98497). Если вы приняли такое решение, вот что нужно сделать:

1. Подать специальное уведомление.
2. Приложить справки о том, что вы – резидент.
3. Приложить отчет о вашей выручке за год.

Все эти документы нужно отправить до 20.01 следующего года.

А если вы вдруг передумали уже после того, как отправили документы на продление бонусов, то у вас есть время до 1 января, чтобы отправить уведомление об отказе. Но запомните: если вы отказались от преференции – обратно ее уже не получить!

Когда можно потерять льготу?

Есть несколько причин, из-за которых можно утратить право на освобождение от налога.

Причина №1: Вы больше не резидент «Сколково»

Если вы по какой-то причине теряете свой статус участника программы, то, к сожалению, вам придется возвратить налог за год, в котором это случилось. И да, к нему еще добавятся пени. Но если вы снова получите этот статус, то сможете получить эту льготу повторно!

Причина №2: Превышена годовая выручка

Право на преференцию также теряется, если ваша годовая выручка будет больше 1 миллиарда. При этом налог придется заплатить с самого начала года, в котором ваша прибыль достигла такой отметки.

Но здесь есть приятный нюанс! Вся прибыль, которую вы получите после этой даты, будет облагаться налогом по ставке 0%. И так будет до тех пор, пока вы не заработаете 300 миллионов рублей или не потеряете статус резидента. Как только вы превысите этот лимит в 300 миллионов, вам придется платить налог по общим правилам и, что важно, доплатить все, что вы не уплатили раньше.

А если вы используете кассовый метод (когда доходы и расходы считаются по факту получения или оплаты), то для вас ограничений по объему выручки просто нет.

Льгота по НДС Сколково. НДС 0 или без НДС?

Резидент Сколково освобождение от НДС получает на 10 лет. Вы можете работать даже на УСН, и все равно пользоваться этой льготой. Но есть исключение: если вы ввозите товары из-за границы, то освобождение от НДС Сколково статья НК РФ 145.1 на них не распространяется.

Даже если вы работаете без НДС, вам все равно нужно оформлять счета-фактуры вашим партнерам. Просто в них должна быть пометка «без НДС». Это надо делать, чтобы все точно знали, как правильно проводить ваши документы.

Каждый год вам нужно подтверждать свое право на льготу через 12 месяцев после ее получения. Участники Сколково освобождены от НДС, но иногда нужно подать декларацию. Например, если вы проводили операции, которые облагаются НДС, или решили отказаться от льготы.

Как уведомить налоговую?

Чтобы воспользоваться освобождением от НДС, просто подайте в ФНС уведомление и подтвердите свой статус. Это все, что нужно! Сделайте это до 20-го числа месяца, следующего за тем, с которого вы пользуетесь льготой. Например, если вы начали работать без НДС в мае, то крайний срок – 20 июня.

Продление освобождения от НДС Сколково

Ее нужно продлевать каждые 12 месяцев с того дня, как вы начали ею пользоваться. Вот что нужно сделать:

1. Отправить в ФНС уведомление.
2. Приложить документы, подтверждающие, что вы все еще резидент «Сколково».
3. Предоставить отчет о ваших финансовых результатах.

Вам нужно уложится в определенный срок. После того, как закончится год, во время которого вы пользовались преимуществами программы, у вас будет 20 дней, чтобы оформить бонусы снова.

Важный нюанс! Если ваша выручка превысила 1 миллиард, то со следующего года, вам придется присылать в налоговую специальный отчет о вашей прибыли. Нужно будет посчитать всю прибыль нарастающим итогом с 1.01 того года, в котором вы превысили этот лимит.

Как отказаться от льготы по НДС?

Вы можете сделать это спустя 12 месяцев после того, как начали ее использовать.

Для этого нужно:

1. Подать в налоговую те же документы, что и для продления.
2. Подать уведомление об отказе.

Если вы уже отослали документы на продление, но потом передумали, у вас есть время, чтобы подать уведомление об отказе до 1-го числа квартала, с которого вы хотите платить НДС по обычным правилам.

Есть две вещи, которые нужно запомнить:

1. Отказаться от льготы по НДС можно лишь по всем вашим операциям сразу, выборочно – не получится.
2. И самое главное! Если вы отказались от льготы, воспользоваться ей повторно вы уже не сможете! Так что это решение должно быть взвешенным.

Когда можно потерять льготу по НДС?

Вот две главные причины, по которым можно ее потерять.

Причина №1: Вы больше не резидент

Если вы по какой-то причине теряете свой статус участника программы, вам придется восстановить весь НДС, который вы не платили. И, конечно, вернуть его в бюджет вместе с пенями. Но есть и хорошая новость: если вы снова станете резидентом, то сможете опять пользоваться освобождением от НДС!

Причина №2: Превышены финансовые лимиты

Ваша выручка за год больше 1 миллиарда (важно: здесь не учитываются проценты по вкладам и доходы с банковских счетов!). Ваша совокупная прибыль (с начала того года, когда вы превысили выручку) стала больше 300 миллионов рублей.

В этом случае НДС-льгота перестает действовать уже с 1-го числа квартала, в котором вы превысили лимит по прибыли. И вам придется восстановить и заплатить НДС и пени за весь этот квартал.

Страховые взносы для участников Сколково в 2025

С 2025 года вступили в силу изменения в порядке применения пониженных тарифов страховых взносов для МСП и резидентов, связывающие их расчет с МРОТ и лимитом базы. 

В рамках налоговой реформы принят Федеральный закон от 29.10.2024 № 362-ФЗ, вносящий поправки в Налоговый кодекс РФ, которые, среди прочего, изменяют правила применения пониженных тарифов страховых взносов для субъектов МСП и резидентов «Сколково». С 1 января 2025 года пониженный тариф применяется только к той части ежемесячных выплат, которая превышает 1,5-кратный размер МРОТ, при этом аналогичный порядок расчета распространяется на субъекты МСП в сфере обрабатывающих производств, которые при соблюдении требований платят взносы по тарифу 7,6% вместо 15%.

При этом ФНС усиливает контроль за корректностью использования данных льгот.

Условия применения льгот: участники обязаны направлять не менее 50% своих расходов на НИОКР, а также не могут заниматься торговлей или арендой, иначе льготы не применяются.

Для участников проекта Сколково налогообложение в части страховых взносов тоже очень комфортное. Ставка всего 14% (все уходит в ПФР, а в ФСС и ФФОМС – по 0%). Это значительно меньше, чем стандартные 30%.

Но есть нюанс! От взносов «на травматизм» резиденты Сколково по правилам налогообложения в 2025 году не освобождаются. Ставки здесь зависят от класса вашего профессионального риска – они составляют от 0,2% до 8,5%.

Налог на имущество

Налог на имущество для резидентов «Сколково» равен 0%. Он распространяется на всё недвижимое имущество компании, числящееся на балансе в качестве основных средств. Льгота действует в течение всего срока резидентства (10 лет). Специальных уведомлений для её применения направлять не требуется. Однако при сдаче декларации в ФНС необходимо приложить выписку из реестра участников и финансовый отчёт, подтверждающий соответствие компании установленным требованиям.

Таможенные преференции

Резиденты Сколково имеют таможенные льготы. Им предоставляется возможность получить обратно деньги, которые они заплатили за ввоз оборудования и комплектующих для научных экспериментов и исследований. Эту помощь участникам Сколково предоставляет сам Фонд «Сколково». Чтобы использовать преференции, нужно заключить договор с брокером таможни и ежегодно подавать заявку.

Дополнительные льготы для IT-компаний

Если вы IT-компания, то вам повезло еще больше! Помимо стандартных преференций, вы можете получить:

• Нулевой налог на прибыль.
• Пониженные взносы – всего 7,6%.
• Запрет на проверки.
• Бронь для ваших IT-специалистов.
• А еще в планах есть ипотека на особых условиях, возмещение НДФЛ Сколково и кредиты под очень низкий процент ≤3%.

Основные налоговые послабления для IT-компаний действуют до 1 января 2025 года. В дополнение к этому находятся в стадии согласования новые меры поддержки: льготная ипотека, возмещение НДФЛ за сотрудников и кредиты под ≤3% годовых.

Кто может получить преференции

Вот что нужно, чтобы получить статус резидента и все его бонусы:

1. Аккредитация в Минцифры. Это, можно сказать, ваш «документ качества», который официально подтверждает, что ваша организация – настоящая IT-компания. Пройти эту аккредитацию несложно, но она обязательна.
2. ОКВЭД 62. Это ваш основной код деятельности. Он должен быть связан с IT-разработкой.
3. Минимум 7 сотрудников. Чтобы претендовать на преференции, в вашей компании должно быть как минимум 7 человек. Это показывает, что вы – уже настоящая, растущая команда.
4. Более 90% дохода от IT-деятельности. Это, наверное, самый важный пункт! Вам нужно доказать, что почти весь ваш доход (минимум 90%) вы получаете именно от разработки программ, предоставления IT-услуг или продажи своего софта.

Требования к источникам дохода

Помните, мы говорили про 90% дохода от IT-деятельности? Так вот, чтобы налоговая не имела к вам претензий, нужно очень четко понимать, что именно входит в эти 90%.

Вы сами должны быть разработчиком софта (хотя бы частично), а не перекупщиком чужих программ! Важно, чтобы ваша компания сама участвовала в разработке, даже если вы отвечали только за какой-то один модуль или часть кода. Это показывает, что ваш продукт – это ваше достижение.

У вас должны быть подтверждающие документы. Это ТЗ, договоры, акты, отчеты. Это ваши доказательства! Без них никак. Нужны:

• техническое задание (где описано, что вы должны сделать);
• договоры с клиентами (где указаны условия);
• акты (которые показывают, что вы сдали работу);
• отчеты (которые подтверждают, что работа выполнена).

И вот еще что важно! Чтобы ваш доход от софта считался официально, нужно правильно оформить договоры. В них должно быть прямо написано, что вы передаете клиенту лицензию на использование вашей программы.

И еще один бонус: в эти 90% могут входить и другие, связанные с программным обеспечением, доходы. Например, деньги, которые вы получаете за техническую поддержку, консультации по использованию софта или его обновление – все это тоже учитывается! Главное, чтобы это было напрямую связано с вашей основной IT-деятельностью.

Как совместить льготы «Сколково» и другие меры поддержки

Сколково отлично сочетается с другими мерами поддержки. Эти льготы могут не просто существовать параллельно, а дополнять друг друга!

Возможность одновременного применения с ИТ-льготами

Вы можете не вносить налоги на полученную прибыль, являясь резидентом «Сколково», и при этом платить меньше страховых взносов, потому что вы аккредитованная IT-компания. Вы получаете сразу два бонуса! 

Важные нюансы при выборе системы налогообложения

А вот здесь нужно быть особенно внимательным. Ваш выбор системы налогообложения (ОСНО или УСН) может сильно повлиять на то, какие преференции вы сможете получить. Например, освобождение от налога на прибыль в Сколково доступно только на ОСНО.

В общем, главный совет такой: если хотите получить максимум выгоды, все нужно хорошенько просчитать! И если сомневаетесь, обязательно поговорите с опытным бухгалтером или консультантом, чтобы точно ничего не упустить.

Практика и риски

Анализ судебной практики показывает, что компании нередко лишаются налоговых льгот из-за формальных нарушений, таких как несоответствие кодов ОКВЭД или несвоевременная подача отчетности. При этом налоговые органы осуществляют не только документальный контроль, но и проверяют фактическое соответствие заявленной деятельности реальной экономической ситуации в компании.

Выгода для инвесторов 

В рамках программы Сколково инвесторы, вкладывающие деньги в стартапы-резиденты, могут рассчитывать на льготы. Одной из них является вычет по НДФЛ. Однако, вычет не всегда может составлять до 100% вложений – льгота ограничена суммой в 20 миллионов рублей (то есть вычет на сумму до 20 млн руб. может быть применен). Это реальная мера, подтвержденная законодательством и регулируемая специальными правилами для резидентов Сколково.

Заключение

Для резидентов Сколково налогообложение в 2025 году очень комфортное. Это не только экономия на налогах, но и мощный стимул для развития компаний. Если правильно спланировать стратегию, учесть налоговые льготы для резидентов Сколково в 2025 году и следить за лимитами, вы сможете использовать все преимущества статуса «резидента».

Информация и материалы, представленные на сайте: skolkovo-resident.ru взяты из открытых источников, расположенных в сети «Интернет». Администрация сайта не имеет какого — либо отношения к Федеральному государственному бюджетному учреждению «Фонд Сколково» и иным институтам развития, а также не является аффилированным лицом по отношению к данным организациям и / или к их сотрудникам.